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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
09/23 |
[農藝館304上課] 課程介紹 ＆ DNA markers and SNP genotyping technology (董致韡) |
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第2週 |
09/30 |
[農藝館304上課] KASP SNP genotyping & Introduction of NGS-based genotyping system (董致韡) |
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第3週 |
10/07 |
簡單重複序列 (SSR) 基因型定型分析實驗（胡凱康） |
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第4週 |
10/14 |
遺傳歧異度分析 PCA (胡凱康) |
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第5週 |
10/21 |
遺傳歧異度分析 PCoA (胡凱康) |
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第6週 |
10/28 |
核心種原 (胡凱康) |
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第7週 |
11/04 |
Introduction to command line in Linux; retrieve NGS data from NCBI SRA database (陳凱儀) |
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第8週 |
11/11 |
Read Alignment (陳凱儀) |
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第9週 |
11/18 |
Identification of genetic variants (陳凱儀) |
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第10週 |
11/25 |
Genome-wide Association Study I (董致韡) |
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第11週 |
12/02 |
Genome-wide Association Study II (董致韡)
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第12週 |
12/09 |
Genetic map construction (R/qtl) (黃永芬) |
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第13週 |
12/16 |
SNP calling without Refseq --stacks (陳凱儀) |
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第14週 |
12/23 |
Bi-parental crossed population I (R/qtl) (黃永芬) |
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第15週 |
12/30 |
Bi-parental crossed population II (R/qtl) (黃永芬) |
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第16週 |
01/06 |
Bi-parental crossed population III (R/qtl) (黃永芬) -- Final presentation |